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本书版于997年出版,该书获得999年“全国科技图书奖”暨“科技进步奖(科技著作)”二等奖和第四届国家图书奖提名奖。艺轩图书出版社还在和香港两地发行了繁体字版本,扩大了本教科书在港台地区的影响。《现代分子生物学》第二版增加了果蝇体节发育、和艾滋病的发生发展等内容,删去了版中有关植物分子生物学的部分章节。新版本仍然分为0章,分别对染色体结构、DNA的复制形式与特点、DNA的转座、遗传密码的破译、蛋白质的合成和运转、基因表达调控的原理、与癌基因活化、免疫缺损病毒(HIV)的分子机制等重大问题作了全面系统的分析,其中第三至九章以较大篇幅叙述了参与原核、真核细胞基因表达调控的各种元件,探讨了DNA甲基化、蛋白质磷酸化及各种不同环境因子对基因活性和基因功能的影响,第十章则讨论了基因组学与比较基因组学研究的新成
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